BLASTN 2.2.3 [May-13-2002]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= BA0AB027D10LP1|AL428723
(867 letters)
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
1807 sequences; 10,358,551 total letters
Searching....done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
3x_Contig1773 1688 0.0
3x_Contig1790 1659 0.0
3x_Contig894 1305 0.0
3x_Contig1614 1127 0.0
3x_Contig1164 472 e-133
3x_Contig1124 188 1e-47
>3x_Contig1773
Length = 8694
Score = 1688 bits (851), Expect = 0.0
Identities = 866/869 (99%), Gaps = 2/869 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 gatcctggcagactcgaaaaggagcaaactatttatgaatttgagactgtgccagaagat 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4624 gatcctggcagactcgaaaaggagcaaactatttatgaatttgagactgtgccagaagat 4683
Query: 61 gaggatgatagctacaacaaaataaaagttccagatggaggctatggctgggtggtggtt 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4684 gaggatgatagctacaacaaaataaaagttccagatggaggctatggctgggtggtggtt 4743
Query: 121 ttctcatccttcttgttaaacttctgcacctctggts-gtcgtatggttacggtgtttac 179
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4744 ttctcatccttcttgttaaacttctgcacctctggtgcgtcgtatggttacggtgtttac 4803
Query: 180 ttgtcatattacatggatagtggaaaatacgaaactggaggtaaactcgactatgctgcc 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4804 ttgtcatattacatggatagtggaaaatacgaaactggaggtaaactcgactatgctgcc 4863
Query: 240 attgggggattgagctttggtgttggggttcttttttctcccttgtacaactatatattg 299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4864 attgggggattgagctttggtgttggggttcttttttctcccttgtacaactatatattg 4923
Query: 300 ataaacacttcaccaaggaagctcatttcgcttggaatcgtcattcagaatgttgccgcg 359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4924 ataaacacttcaccaaggaagctcatttcgcttggaatcgtcattcagaatgttgccgcg 4983
Query: 360 ttactagctgccttttctaccaaattatggcaggtgtatctgactcaaggtgtgttcatc 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4984 ttactagctgccttttctaccaaattatggcaggtgtatctgactcaaggtgtgttcatc 5043
Query: 420 tcaataggtacaggcgcaatatgctttccaaacactacaatagccgcaccatggtttagg 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5044 tcaataggtacaggcgcaatatgctttccaaacactacaatagccgcaccatggtttagg 5103
Query: 480 aagaaaagatccctagctctggggattaccgtggccggtac-ggggttggaggaatcgtt 538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 5104 aagaaaagatccctagctctggggattaccgtggccggtacgggggttggaggaatcgtt 5163
Query: 539 ttcaacctctccacccaacgcattattgataattatgattccaagtgggcgttgatttct 598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5164 ttcaacctctccacccaacgcattattgataattatgattccaagtgggcgttgatttct 5223
Query: 599 caatgtatcatatgctcagtgctgagtactgtagcggtgcttttgattagaaccagaaga 658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5224 caatgtatcatatgctcagtgctgagtactgtagcggtgcttttgattagaaccagaaga 5283
Query: 659 gacgaggttcagaagtattctgatacgcccacaacagcagtggcgctggatatgttcaag 718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5284 gacgaggttcagaagtattctgatacgcccacaacagcagtggcgctggatatgttcaag 5343
Query: 719 tacccagtgatatggttattgatcctttgggtgtgtttcaccatgcttggttatgttgtt 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5344 tacccagtgatatggttattgatcctttgggtgtgtttcaccatgcttggttatgttgtt 5403
Query: 779 caggtctattctctgttctcgtttacgatttctctcggctacacttccaaacaagcctcg 838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5404 caggtctattctctgttctcgtttacgatttctctcggctacacttccaaacaagcctcg 5463
Query: 839 gcggtgtcctgtgttatatgtgtgggaat 867
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5464 gcggtgtcctgtgttatatgtgtgggaat 5492
>3x_Contig1790
Length = 27369
Score = 1659 bits (836), Expect = 0.0
Identities = 865/870 (99%), Gaps = 4/870 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 gatcctggcagactcgaaaaggagcaaactatttatgaatttgagactgtgccagaagat 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1060 gatcctggcagactcgaaaaggagcaaactatttatgaatttgagactgtgccagaagat 1119
Query: 61 gaggatgatagctacaacaaaataaaagttccagatggaggctatggctgggtggtggtt 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1120 gaggatgatagctacaacaaaataaaagttccagatggaggctatggctgggtggtggtt 1179
Query: 121 ttctcatccttcttgttaaacttctgcacctctggts-gtcgtatggttacggtgtttac 179
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1180 ttctcatccttcttgttaaacttctgcacctctggtgcgtcgtatggttacggtgtttac 1239
Query: 180 ttgtcatattacatggatagtggaaaatacgaaactggaggtaaactcgactatgctgcc 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1240 ttgtcatattacatggatagtggaaaatacgaaactggaggtaaactcgactatgctgcc 1299
Query: 240 attgggggattgagctttggtgttggggttcttttttctcccttgtacaactatatattg 299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1300 attgggggattgagctttggtgttggggttcttttttctcccttgtacaactatatattg 1359
Query: 300 ataaacacttcaccaaggaagctcatttcgcttggaatcgtcattcagaatgttgccgcg 359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1360 ataaacacttcaccaaggaagctcatttcgcttggaatcgtcattcagaatgttgccgcg 1419
Query: 360 ttactagctgccttttctaccaaattatggcaggtgtatctgactcaaggtgtgttcatc 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1420 ttactagctgccttttctaccaaattatggcaggtgtatctgactcaaggtgtgttcatc 1479
Query: 420 tcaataggtacaggcgcaatatgctttccaaacactacaatagccgcaccatggtttagg 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1480 tcaataggtacaggcgcaatatgctttccaaacactacaatagccgcaccatggtttagg 1539
Query: 480 aagaaaagatccctagctct-ggggattaccgt-ggccggtacggggttggaggaatcgt 537
|||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1540 aagaaaagatccctagctctgggggattaccgtgggccggtacggggttggaggaatcg- 1598
Query: 538 tttcaacctctccacccaacgcattattgataattatgattccaagtgggcgttgatttc 597
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1599 tttcaacctctccacccaacgcattattgataattatgattccaagtgggcgttgatttc 1658
Query: 598 tcaatgtatcatatgctcagtgctgagtactgtagcggtgcttttgattagaaccagaag 657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1659 tcaatgtatcatatgctcagtgctgagtactgtagcggtgcttttgattagaaccagaag 1718
Query: 658 agacgaggttcagaagtattctgatacgcccacaacagcagtggcgctggatatgttcaa 717
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1719 agacgaggttcagaagtattctgatacgcccacaacagcagtggcgctggatatgttcaa 1778
Query: 718 gtacccagtgatatggttattgatcctttgggtgtgtttcaccatgcttggttatgttgt 777
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1779 gtacccagtgatatggttattgatcctttgggtgtgtttcaccatgcttggttatgttgt 1838
Query: 778 tcaggtctattctctgttctcgtttacgatttctctcggctacacttccaaacaagcctc 837
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1839 tcaggtctattctctgttctcgtttacgatttctctcggctacacttccaaacaagcctc 1898
Query: 838 ggcggtgtcctgtgttatatgtgtgggaat 867
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1899 ggcggtgtcctgtgttatatgtgtgggaat 1928
>3x_Contig894
Length = 1786
Score = 1305 bits (658), Expect = 0.0
Identities = 676/680 (99%), Gaps = 2/680 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 gatcctggcagactcgaaaaggagcaaactatttatgaatttgagactgtgccagaagat 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 681 gatcctggcagactcgaaaaggagcaaactatttatgaatttgagactgtgccagaagat 622
Query: 61 gaggatgatagctacaacaaaataaaagttccagatggaggctatggctgggtggtggtt 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 621 gaggatgatagctacaacaaaataaaagttccagatggaggctatggctgggtggtggtt 562
Query: 121 ttctcatccttcttgttaaacttctgcacctctggts-gtcgtatggttacggtgtttac 179
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 561 ttctcatccttcttgttaaacttctgcacctctggtgcgtcatatggttacggtgtttac 502
Query: 180 ttgtcatattacatggatagtggaaaatacgaaactggaggtaaactcgactatgctgcc 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 501 ttgtcatattacatggatagtggaaaatacgaaactggaggtaaactcgactatgctgcc 442
Query: 240 attgggggattgagctttggtgttggggttcttttttctcccttgtacaactatatattg 299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 441 attgggggattgagctttggtgttggggttcttttttctcccttgtacaactatatattg 382
Query: 300 ataaacacttcaccaaggaagctcatttcgcttggaatcgtcattcagaatgttgccgcg 359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 381 ataaacacttcaccaaggaagctcatttcgcttggaatcgtcattcagaatgttgccgcg 322
Query: 360 ttactagctgccttttctaccaaattatggcaggtgtatctgactcaaggtgtgttcatc 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 321 ttactagctgccttttctaccaaattatggcaggtgtatctgactcaaggtgtgttcatc 262
Query: 420 tcaataggtacaggcgcaatatgctttccaaacactacaatagccgcaccatggtttagg 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 261 tcaataggtacaggcgcaatatgctttccaaacactacaatagccgcaccatggtttagg 202
Query: 480 aagaaaagatccctagctctggggattaccgtggccggtac-ggggttggaggaatcgtt 538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 201 aagaaaagatccctagctctggggattaccgtggccggtacgggggttggaggaatcgtt 142
Query: 539 ttcaacctctccacccaacgcattattgataattatgattccaagtgggcgttgatttct 598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 141 ttcaacctctccacccaacgcattattgataattatgattccaagtgggcgttgatttct 82
Query: 599 caatgtatcatatgctcagtgctgagtactgtagcggtgcttttgattagaaccagaaga 658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 81 caatgtatcatatgctcagtgctgagtactgtagcggtgcttttgattagaaccagaaga 22
Query: 659 gacgaggttcagaagtattc 678
||||||||||||||||||||
Sbjct: 21 gacgaggttcagaagtattc 2
>3x_Contig1614
Length = 4869
Score = 1127 bits (568), Expect = 0.0
Identities = 583/586 (99%), Gaps = 2/586 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 gatcctggcagactcgaaaaggagcaaactatttatgaatttgagactgtgccagaagat 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4271 gatcctggcagactcgaaaaggagcaaactatttatgaatttgagactgtgccagaagat 4330
Query: 61 gaggatgatagctacaacaaaataaaagttccagatggaggctatggctgggtggtggtt 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4331 gaggatgatagctacaacaaaataaaagttccagatggaggctatggctgggtggtggtt 4390
Query: 121 ttctcatccttcttgttaaacttctgcacctctggts-gtcgtatggttacggtgtttac 179
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4391 ttctcatccttcttgttaaacttctgcacctctggtgcgtcgtatggttacggtgtttac 4450
Query: 180 ttgtcatattacatggatagtggaaaatacgaaactggaggtaaactcgactatgctgcc 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4451 ttgtcatattacatggatagtggaaaatacgaaactggaggtaaactcgactatgctgcc 4510
Query: 240 attgggggattgagctttggtgttggggttcttttttctcccttgtacaactatatattg 299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4511 attgggggattgagctttggtgttggggttcttttttctcccttgtacaactatatattg 4570
Query: 300 ataaacacttcaccaaggaagctcatttcgcttggaatcgtcattcagaatgttgccgcg 359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4571 ataaacacttcaccaaggaagctcatttcgcttggaatcgtcattcagaatgttgccgcg 4630
Query: 360 ttactagctgccttttctaccaaattatggcaggtgtatctgactcaaggtgtgttcatc 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4631 ttactagctgccttttctaccaaattatggcaggtgtatctgactcaaggtgtgttcatc 4690
Query: 420 tcaataggtacaggcgcaatatgctttccaaacactacaatagccgcaccatggtttagg 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4691 tcaataggtacaggcgcaatatgctttccaaacactacaatagccgcaccatggtttagg 4750
Query: 480 aagaaaagatccctagctctggggattaccgtggccggtac-ggggttggaggaatcgtt 538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 4751 aagaaaagatccctagctctggggattaccgtggccggtacgggggttggaggaatcgtt 4810
Query: 539 ttcaacctctccacccaacgcattattgataattatgattccaagt 584
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 4811 ttcaacctctccacccaacgcattattgataattatgattccaagt 4856
>3x_Contig1164
Length = 2302
Score = 472 bits (238), Expect = e-133
Identities = 328/356 (92%), Gaps = 2/356 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 gatcctggcagactcgaaaaggagcaaactatttatgaatttgagactgtgccagaagat 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1937 gatcctggcagactcgaaaaggagcaaactatttatgaatttgagactgtgccagaagat 1996
Query: 61 gaggatgatagctacaacaaaataaaagttccagatggaggctatggctgggtggtggtt 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1997 gaggatgatagctacaacaaaataaaagttccagatggaggctatggctgggtggtggtt 2056
Query: 121 ttctcatccttcttgttaaacttctgcacctctggtsg-tcgtatggttacggtgtttac 179
|||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | || |||||||| ||||||||
Sbjct: 2057 ttctcatccttcttgttaaacttctggagctctggtggttcatatggttagggtgtttag 2116
Query: 180 ttgtcatattacatggatagtggaaaatacgaaactggaggtaaactcgactatgctgcc 239
|||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||
Sbjct: 2117 ttgtgatattagatggatagtggaaaataggaaactggaggtaaactggagtatggtggg 2176
Query: 240 att-gggggattgagctttggtgttggggttcttttttctcccttgtacaactatatatt 298
||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||
Sbjct: 2177 attggggggattgaggtttggtgttgggggtgttttttgtgccttgtacaactatatatt 2236
Query: 299 gataaacacttcaccaaggaagctcatttcgcttggaatcgtcattcagaatgttg 354
|||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||| || ||| |||||||||
Sbjct: 2237 gataaagacttcaccaaggaagctgatttgggttggaatggtgattgagaatgttg 2292
>3x_Contig1124
Length = 2635
Score = 188 bits (95), Expect = 1e-47
Identities = 95/95 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 773 gttgttcaggtctattctctgttctcgtttacgatttctctcggctacacttccaaacaa 832
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 15 gttgttcaggtctattctctgttctcgtttacgatttctctcggctacacttccaaacaa 74
Query: 833 gcctcggcggtgtcctgtgttatatgtgtgggaat 867
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 75 gcctcggcggtgtcctgtgttatatgtgtgggaat 109
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
Posted date: Nov 27, 2002 12:23 PM
Number of letters in database: 10,358,551
Number of sequences in database: 1807
Lambda K H
1.38 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.38 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 5497
Number of Sequences: 1807
Number of extensions: 5497
Number of successful extensions: 47
Number of sequences better than 1.0e-20: 6
length of query: 867
length of database: 10,358,551
effective HSP length: 16
effective length of query: 851
effective length of database: 10,329,639
effective search space: 8790522789
effective search space used: 8790522789
T: 0
A: 40
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.8 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 50 (99.7 bits)